Hvis man som offentligt ansat skal beskæftige sig med klassificerede informationer, er det en forudsætning, at man er blevet sikkerhedsgodkendt. Dette er et krav i henhold til Statsministeriets sikkerhedscirkulære (Cirk. nr. 204 af 7. december 2001). For ansatte indenfor Forsvarsministeriets område er det Den Militære Sikkerhedstjeneste ved FE, der foretager sikkerhedsgodkendelsen. Det samme gælder for ansatte i private virksomheder, der leverer varer eller tjenesteydelser til forsvaret.

Ifølge sikkerhedscirkulæret skal afgørelser om sikkerhedsgodkendelse træffes på grundlag af en konkret vurdering. Der skal især lægges vægt på, om den pågældende person har en sådan adfærd og karakter, at der ikke kan være tvivl om pågældendes pålidelighed med hensyn til håndtering af klassificerede informationer. Oplysninger om en ægtefælles eller samlevers adfærd og karakter kan også tillægges betydning. Sager om sikkerhedsgodkendelse behandles efter Forvaltningslovens regler, herunder reglerne om partshøring, aktindsigt, begrundelse af afgørelser og klagevejledning.

Afgørelser om sikkerhedsgodkendelse træffes på grundlag af oplysninger, som den pågældende person selv giver ved udfyldelsen af et oplysningsskema, og de oplysninger FE rekvirerer fra myndigheder inden for Forsvarsministeriets område og fra Politiets Efterretningstjeneste (PET). Ved godkendelser til de lavere klassifikations-grader foretager PET normalt kun et registermæssigt check af, om personen er kendt i politiets registre, herunder mht. strafbare forhold, misbrugsproblemer og fremstillinger i retten. Ved godkendelser til de højeste klassifikationsgrader foretager PET en grundigere personundersøgelse, hvor der evt. indhentes oplysninger fra tidligere arbejdsgivere, uddannelsesinstitutioner, forretningsforbindelser og andre, der kender den undersøgte.

I forbindelse med sikkerhedsgodkendelser får FE kun oplysninger fra Politiets Efterretningstjeneste, hvis den pågældende person har givet sit udtrykkelige samtykke hertil. Bortset fra Kriminalregistrets oplysninger om domme og sigtelser forelægger PET alle oplysninger for Wamberg-udvalget, før de videregives til FE. Wamberg-udvalget fører også tilsyn med FE’s registrering af oplysninger.

FE tilintetgør alle oplysninger om en person, når der ikke længere er behov for, at den pågældende har en sikkerhedsgodkendelse. Oplysninger om sikkerhedsgodkendte personer tilintetgøres således senest ved ansættelsesforholdets ophør, herunder ved pensionering. Oplysninger om værnepligtigt personel tilintetgøres senest 24 måneder efter, at sikkerhedsgodkendelsen er meddelt den pågældende. Wamberg-udvalget fører kontrol med, at oplysninger tilintetgøres som beskrevet.